Als het nodig is kan EMDR onderdeel uitmaken van de behandeling. EMDR kan worden ingezet als een kind of jongere problemen blijft houden na een  het meemaken van een schokkende gebeurtenis.

De toepassing van EMDR is mogelijk bij kinderen en jongeren van alle leeftijden. Ook ingrijpende gebeurtenissen die plaatsvonden voor de taalontwikkeling op gang is gekomen, kunnen met EMDR worden verwerkt. Bij (heel) jonge kinderen krijgen ouders of verzorgers een belangrijk aandeel in de behandeling.